Η αποστολή του Τομέα Μεταφορών και Συγκοινωνιακής Υποδομής (ΜΣΥ) είναι η εκπαίδευση επιστημόνων μηχανικών και η προώθηση της επιστήμης των μεταφορών και της συγκοινωνιακής υποδομής. Βασικοί στόχοι σε όλες τις εκπαιδευτικές και ερευνητικές δραστηριότητες του Τομέα ΜΣΥ είναι τα υψηλά επιστημονικά πρότυπα και οι υψηλές επιδόσεις.

Ο Τομέα ΜΣΥ αποτελείται από τρία εργαστήρια: Εργαστήριο Οδοποιίας, Εργαστήριο Σιδηροδρομικής και Μεταφορών και Εργαστήριο Κυκλοφοριακής Τεχνικής, που στελεχώνονται με άρτια καταρτισμένο προσωπικό (συνολικά πάνω από 70 μέλη και 6 μέλη ΔΕΠ). Ο Τομέας προσφέρει 16 προπτυχιακά μαθήματα στη Σχολή Πολιτικών Μηχανικών και συμβάλλει σε άλλα 6 προπτυχιακά και μεταπτυχιακά μαθήματα σε άλλες Σχολές του ΕΜΠ. Τα τελευταία 33 χρόνια έχει παραχθεί ιδιαίτερα καινοτόμος έρευνα μέσα από περισσότερες από 60 διδακτορικές διατριβές και σε περισσότερα από 300 εθνικά, ευρωπαϊκά και διεθνή ερευνητικά έργα, τα οποία οδήγησαν σε περισσότερες από 1.000 δημοσιεύσεις σε διεθνή επιστημονικά περιοδικά και πρακτικά συνεδρίων με χιλιάδες ετερο-αναφορές παγκοσμίως.